高效液相色谱仪常用色谱柱有C18柱、C8柱、C4柱、C2柱、C1柱和NH2柱等。
一、C18柱：
又称ODS柱，使用普遍，品种繁多。值得注意的是同样的C18柱，得到的结果可能不一致，尤其是分析极性或离子化合物。
流动相为甲醇（乙腈）水系统。
适合大多数化合物的分析。
二、C8柱：
类同于C18柱，保留能力比C18柱差。
三、C4柱、C2柱和C1柱：
用于反相，寿命较短。
适合一些特定化合物的分析。
四、NH2柱：
既能用于反相又可用于正相。
常用于小分子糖的分析。
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