控制芯片负责协调光电鼠标中各元器件的工作，并与外部电路进行沟通（桥接）及各种信号的传送和收取。
光学鼠标通过底部的LED灯，灯光以约 30度角射向桌面，照射出粗糙的表面所产生的阴影，然后再通过平面的折射透过另外一块透镜反馈到传感器上。 当鼠标移动的时候，成像传感器录得连续的图案，然后通过“数字信号处理器”(DSP)对每张图片的前后对比分析处理，以判断鼠标移动的方向以及位移，从而得出鼠标在屏幕上的坐标值，再通过SPI传给鼠标的微型控制单元(Micro Controller Unit)。鼠标的处理器对这些数值处理之后，传给电脑主机。
光学鼠标与机械式鼠标大的不同之处在于其定位方式不同[1] 。
光学鼠标的工作原理是：在光学鼠标内部有一个发光二极管，通过该发光二极管发出的光线，照亮光电鼠标底部表面（这就是为什么鼠标底部总会发光的原因）。然后将光电鼠标底部表面反射回的一部分光线，经过一组光学透镜，传输到一个光感应器件（微成像器）内成像。这样，当光学鼠标移动时，其移动轨迹便会被记录为一组高速拍摄的连贯图像。后利用光电鼠标内部的一块专用图像分析芯片（DSP，即数字微处理器）对移动轨迹上摄取的一系列图像进行分析处理，通过对这些图像上特征点位置的变化进行分析，来判断鼠标的移动方向和移动距离，从而完成光标的定位。
第二代光学鼠标的原理说来其实很简单：它采用了一种光眼技术，也就是数字光电技术，利用红外线照射鼠标所在物体的表面，然后每隔一定的时间（几毫秒）就做一次快照，接着分析处理两次图片的特性，来决定坐标的移动方向及数值。由于需要对图片进行扫描才能确定鼠标的位移，因此这个扫描的频率就成为衡量光电鼠标的一项重要参数。而这款飞狐鼠标由于采用了明基BenQ独特的“微型光学定位系统”，每秒钟能够发射1500次感光信号来扫描物体表面，取得图像后通过DSP数字信号处理器将每个细微的移动方向与距离迅速而准确地回传。飞狐还拥有高达800DPI的分辨率，使得光标定位更加精准，高速的传感器也可以避免指针的抖动和不规则移动现象，提高瞄准精度。让我们在各种操作环境下都能得心应手。
鼠标的光学传感器对鼠标被放置的表面进行扫描，并以1500次/秒的频率捕捉图像，进行对比，从而确定鼠标的定位。传统光学鼠标使用的光学芯片扫描次数普遍为1500次/秒(所谓扫描次数，即光学定位芯片每秒采集和处理图像的数量)，高只可以追踪14～18英寸/秒的移动速度。鼠标移动速度如果超出此范围，则可能发生光标无法准确定位的情况。而用户使用电脑时，鼠标的移动速度高可达到30英寸/秒，尤其是在如CS一类的FPS游戏中，这就会产生前文所述的鼠标突然失控的问题。